Tối ưu hóa phản ứng real-time PCR phát hiện vi khuẩn Streptococcus pneumoniae gây viêm phổi cộng đồng ở người lớn

Streptococcus pneumoniae là tác nhân hàng đầu gây viêm phổi cộng đồng ở người lớn. Trong xét nghiệm vi sinh, phương pháp nuôi cấy đang là “Tiêu chuẩn vàng” tuy nhiên phương pháp này tốn nhiều thời gian trả kết quả. Nghiên cứu tiến hành xây dựng quy trình tối ưu hóa phản ứng real-time PCR với cặp mồi và mẫu dò đặc hiệu cho gen cpsA phát hiện vi khuẩn Streptococcus pneumoniae gây viêm phổi cộng đồng ở người lớn. Mục tiêu nghiên cứu: Xây dựng quy trình real-time PCR phát hiện vi khuẩn Streptococcus pneumoniae gây viêm phổi cộng đồng ở người lớn. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Nghiên cứu thử nghiệm trên chủng vi khuẩn Streptococcus pneumoniae ATCC 6305. Tiến hành thiết kế cặp mồi và mẫu dò, sau đó tối ưu nhiệt độ bắt cặp, nồng độ mồi, mẫu dò, khảo sát độ đặc hiệu và độ nhạy của phản ứng. Kết quả: Tối ưu hóa chọn cặp mồi và đoạn dò của gen cpsA để sử dụng cho quy trình phát hiện vi khuẩn Streptococcus pneumoniae. Nghiên cứu tối ưu hóa nhiệt độ bắt cặp ở mức 57,1⁰C, nồng độ mẫu dò 0,25μM và nồng độ mồi 0,3 μM. Độ đặc hiệu của phản ứng là 100%, độ nhạy đạt 6,4x102 bản sao với độ chính xác 98,22% và hiệu suất phản ứng là 97,1%. Kết luận: Nghiên cứu đã xây dựng thành công quy trình real-time PCR phát hiện vi khuẩn Streptococcus pneumoniae gây bệnh viêm phổi cộng đồng.